保稅制度在國際貿易中的廣泛應用，使這一制度涉及的保稅貨物成為進出口貨物的一個重要內容，保稅貨物的通關程序與一般進出口貨物有著明細區別，保稅貨物的一般含義是指“進入一國關境，在海關監管下未繳納進口稅捐，存放后再復運出口的貨物。”《中華人民共和國海關法》對“保稅貨物”的定義是：“經海關批準未辦理納稅手續進境，在境內存儲、加工、裝配后復運出境的貨物”。
保稅貨物的特征：
1、特定目的，我國《海關法》將保稅貨物限定為二種特定目的而進口的貨物，即進行貿易活動（儲存）和加工制造活動（加工、裝配），將保稅貨物與為其他目的暫時進口的貨物（如工程施工、科學實驗、文化體育活動等）區別開來。
2、暫免納稅，《海關法》第43條規定：“經海關批準暫時進口或暫時出口的貨物，以及特準進口的保稅貨物，在貨物收、發貨人向海關繳納相當于稅款的保證金或提供擔保后，將予暫時免納關稅”保稅貨物未辦理納稅手續進境，屬于暫時免納，而不是免稅，待貨物最終流向確定后，海關再決定征稅或免稅。
3、復運出境，這是構成保稅貨物的重要前提從法律上講，保稅貨物未按一般貨物辦理進口和納稅手續，因此，保稅貨物必須以原狀或加工后產品復運出境，這既是海關對保稅貨物的監管原則，也是經營者必須履行的法律義務，保稅貨物的通關與一般進出口貨物不同，它不是在某一個時間上辦理進口或出口手續后即完成了通關，而是從進境、儲存或加工到復運出境的全過程，只有辦理了這一整個過程的各種海關手續后，才真正完成了保稅貨物的通關。
保稅貨物通關的基本程序包括四個環節：合同備案-進口貨物-復運出口-核銷結案。
1、合同登記備案是指經營保稅貨物的單位持有關批件、對外簽約的合同及其他有關單證，向主管海關申請辦理合同登記備案手續，海關批準后，簽發有關登記手冊。合同登記備案是向海關辦理的第一個手續，須在保稅貨物進口前辦妥，它是保稅業務的開始，也是經營者與海關建立承擔法律責任和履行監管職責的法律關系的起點。
2、進口貨物是指已在海關辦理合同登記備案的保稅貨物實際進境時，經營單位或其代理人應持海關核發的該批保稅貨物的《登記手冊》及其他單證，向進境地海關申報，辦理進口手續。
3、儲存或加工后復運出口是指保稅貨物進境后，應儲于海關指定的場所或交付給海關核準的加工生產企業進行加工制造在儲存期滿或加工產品后再復運出境經營單位或其代理人應持該批保稅貨物的《登記手冊》及其他單證，向出境地海關申報辦理出口手續。
4、核銷結案是指在備案合同期滿或加工產品出口后的一定期限內，經營單位應持有關加工貿易登記手冊、進出口貨物報關單及其他有關資料，向合同備案海關辦理核銷手續，海關對保稅貨物的進口、儲存、加工、使用和出口情況進行核實并確定最終征免稅意見后，對該備案合同予以核銷結案。這一環節是保稅貨物整個通關程序的終點，意味著海關與經營單位之間的監管法律關系的最終解除。