根據國稅公告2012 24號，貿易公司發生退運時，如果原出口業務未退稅的，直接開具退運未退稅證明；如果已退稅的，則需要先把退稅款退還給稅局，并開具退運已補稅證明
生產企業發生退運時，如果原出口貨物未申報退稅的，直接開具退運未退稅證明；如果已退稅的，則需要在發生退運的次月申報期內，在退稅系統中用負數沖減原退稅明細數據(注：原國稅公告2012 24號要求生產企業跨年的補稅，當年的沖減，國稅公告2013 12號修改為不論跨年還是當年都實行沖減)，
生產企業開具退運已補稅證明時需要注意有兩種模式：
1、如果當期所屬期還未申報退稅時，可以以當期所屬期開具，并在沖減所屬期那里錄當期所屬期。開具后，在申報當期所屬期退稅時需要進行負數沖減
2、如果當期所屬期已經申報完退稅，則在開具退運證明時需要選擇下期作為所屬期，并在沖減所屬期那里錄下期所屬期，開局后，在申報下期所屬期退稅時，進行負數沖減
舉個栗子：
2016年5月份所屬期，如果該企業在6月份還未申報5月份退稅，則可以用201605所屬期開具，并在沖減所屬期那里錄201605。開具后，企業在申報5月份退稅時需要負數錄入該票退運的明細進行沖減；如果該企業已經在6月份申報了5月份的退稅，則企業在6月份開具退運證明時，需要用201606所屬期進入開具，并在沖減所屬期那里錄201606，等到7月份，在申報6月份退稅時，需要負數錄入退運數據進行沖減。
生產企業開具退運未退稅證明時，沖減所屬期一定要空著，因為不需要沖減。
退運證明需要提交的資料：
退運證明電子數據及如下紙質資料：
1.出口貨物報關單（退運發生時已申報退稅的，不需提供）；
2.出口發票（外貿企業不需提供）；
3.稅收通用繳款書原件及復印件（退運發生時未申報退稅的、以及生產企業不需提供）；
4.主管稅務機關要求報送的其他資料。
賬務處理：
采用會計準則的企業：
跨年退運，如果屬于資產負債表日后事項的，需要調整以前年度數據
如果非跨年或不屬于資產負債表日后事項的，直接在退運時沖減當期數據
采用小企業會計準則的企業，直接在退運時沖減當期數據
稅務處理：
根據國稅函2008 875號規定，直接沖減當期收入
增值稅處理：
若本年退運，則直接沖減免稅銷售額或免抵退銷售額；若跨年退運，可不沖減，或去大廳手工沖減以前年度的增值稅申報表