增值稅的計算方法有直接計算法和間接計算法之分。所謂直接計算法是指先直接計算出增值額，再乘以稅率，求出應納增值稅的方法。具體運用上又分為加法（將構成增值額的各要素相加）和減法（又稱扣額法，以產品銷售額扣除法定扣除額后的余額作為增值額）。所謂間接計算法，又叫扣稅法，是指并不直接計算增值額，而采用抵扣稅款的方法，計算應納增值稅的稅額。
目前，我國采用國際上普遍采行的扣稅法，在計算納稅人的應納增值稅稅額時，可以按照稅法規定的范圍憑進貨發票注明的稅額，從當期的銷項稅額中抵扣購進貨物或者應稅勞務已繳納的增值稅稅額（即進項稅額）。
其計算公式為：應納稅額=當期銷項稅額一當期進項稅額
從計算公式不難看出，增值稅的計算取決于當期的銷項稅額和當期的進項稅額兩個因素。
銷項稅額的確定
銷項稅額是指納稅人銷售貨物或者提供應稅勞務，按照銷售額和規定稅率計算的增值稅稅額。該銷項稅額按照規定在銷售額之外一并向購買方收取，其公式為：銷項稅額=銷售額X稅率