1：國內一般貿易企業轉廠給加工貿易企業（外資企業）。
深圳A工廠是電線生產商，銷售電線給蘇州B企業，B企業屬于臺資企業，有加工手冊。B企業要求A企業做轉廠交貨，A企業是國內一般制造工廠，有進出口權，產品出口需要退稅。因此以A工廠的名義出口貨物到深圳出口加工區我司辦理出口報關手續，蘇州B企業用手冊報關進口（進口免稅）A工廠出口后可以享受出口退稅政策，同時也解決了B企業免稅進口目的。整個流程只需要兩到三個小時。
2、加工貿易企業A轉廠給另一家貿易企業B（進料對口）
順德企業C是生產棉紗線的港資企業，有加工手冊。東莞企業D是時裝生產商，屬于臺資企業也有加工手冊，以前C企業銷售棉紗線給D企業都是通過關封做深加工結轉交貨的，目前因為順德企業有部分原材料是國內開票采購的，為了達到出口退稅目的，順德企業C把貨物出口到坪山保稅區，東莞D企業再用手冊報關進口。順德C企業享受出口退稅的同時，也解決了兩個企業料件的結轉交貨問題。
3、 加工貿易企業轉廠給國內一般貿易企業（出口轉內銷）
深圳某生產體育用品的企業E屬于美資企業，有加工手冊，因為E企業保稅進口原材料在中國生產的產品需要出口核銷的，不能直接在國內銷售。但國內一般貿易公司F需要采購E工廠的產品在國內進行銷售，因為兩家公司不能直接在國內交貨。加工貿易企業E用手冊將產品出口到深圳出口加工區（保稅區）國內貿易公司F再以一般貿易征稅進口到國內銷售。
4、 同一家企業手冊之間料件結轉，等同于舊手冊料件退港，新手冊申報進料對口。
加工貿易企業手冊置換，舊手冊料件需要轉到新手冊的，可通過深圳出口加工區報關進行舊手冊料件復出，新手冊料件進料對口完成。
第四：問：在坪山出口加工區（保稅區）出現之前企業是如何完成轉廠交貨的？
答：深圳出口加工區（坪山保稅區）是2009年國家總署等相關部門批轉開展保稅物流，保稅區檢測維修，保稅區商品展示等業務，在之前深圳出口加工區只是作為一個外資企業的海關監管區。
國內企業一般都是通過把貨物出口到香港然后再申報進口這樣來完成轉廠，拿到報關單來核銷加工貿易企業的手冊。也就是香港一日游，香港一日游時效長，路途遠，中港車費用高，有時候可能會產生押夜的情況。
坪山出口加工區（境內關外性質）批準開展保稅物流之后，企業從香港一日游轉到坪山出口加工區做轉廠，即保稅區一日游。
第五：問：深圳出口加工區（坪山保稅區）為什么可以開展轉廠業務？
答：1、監管模式，深圳出口加工區境內關外的特殊性質，貨物從國內工廠進入保稅區相當于出口，企業需要做出口報關，貨物從保稅區進到國內工廠相當于進口，企業需要申報進口報關。
2、 坪山保稅區“入區退稅”政策，國家為了鼓勵出口，貨物從國內工廠進入保稅區視同離境，企業可以辦理出口退稅。
3、其功能完全代替香港，坪山保稅區做轉廠可以提前報關，提前征稅。從貨物進入保稅區之后兩到三個小時即可完成出口和進口報關。無須卸貨，無須換車，無須倉儲。