根據微生物的分類，光合細菌共包括1目( 紅螺菌目) 、4科( 紅螺菌科，著色菌科，綠菌科，綠絲菌科)，目前在水產上面應用比較多的是紅螺菌科的種類（沼澤紅假單胞菌，莢膜紅假單胞菌等），它們的代謝方式為光能異養，兼性厭氧。即在黑暗的條件下，能利用有機物作為呼吸基質進行好氧或異養生長，在厭氧光照的條件下，能利用低級脂肪酸，多種二羧酸，醇類，糖類，芳香族化合物等多種低分子有機物作為供氫體和電子受體，進行不產氧的光合作用。
光合細菌的功效：
1、保水穩定水色，調理、養護、改善水質，降解氨氮、 亞硝酸鹽、硫化氫等有害物質，凈化水質，增加水體的溶解氧。
2、能調節菌相與藻相平衡，穩定水色與PH值，提高透明度。
3、通過增強免疫，減少養殖動物因應激而引起的發 病，減少因應激性而引的不吃料。
4、添加高濃度的蝦青素成分，促進動物 機體抗氧化能力，提高成活率，減少發病率。
5、能用于養殖觀賞魚時，可增強觀賞魚體色的艷麗度。