馬來西亞聯邦政府和各州政府實行分稅制。聯邦財政部統一管理全國稅務，負責制定稅收政策。馬來西亞公司不管是否經營，都必須做賬報稅，確認及更新馬來西亞公司注冊資料，保證公司經營合法性。同時，不管是馬來西亞公民或外國人，只要一年內在馬來西亞居住超過182天，就有報稅的義務。
馬來西亞也的稅務優惠政策
1、鼓勵國內投資與資本性投資的措施，新興企業投產 5 年內有70%的法定所得免納所得稅；
2、從事資本密集型和高技術投資的企業可以按照逐案審查原則給予全部免稅，免稅期設定在5年；
3、其他免稅項目還包括納入國家重點戰略的森林種植計劃和多媒體通道以及電子芯片的生產等。
4、對再投資生產重型機械和普通機械、設備的公司給予再投資優惠。再投資減免額為5年內進行再投資所產生增量收入的70%；
5、利用椰油生物資源和再投資生產附加值產品的企業，其利潤給予全額免稅優惠，優惠期10年；
6、促進出口的優惠措施，對制造業、農業、飯店、旅游以及服務部門為促進產品出口而產生的費用，采取雙倍扣除等優惠措施。
7、技術與職業培訓的扣除，對經批準的培訓雇員項目發生的費用允許雙倍扣除；培訓費用雙倍扣除的規定同樣適用于中小型制造業公司。
馬來西亞公司的稅種
直接稅：企業所得稅、不動產利得稅等；
間接稅：國產稅、關稅和進出口稅、銷售稅、服務稅、印花稅；
馬來西亞公司主要稅率
公司所得稅：公司20%-25%；
個人所得稅：0%-26%（居住民）、26%（非居住民）；
銷售稅：0%-25%；
服務稅：6%；
國產稅：15%-105%；
不動產利得稅：0%-30%，根據不動產年限而定，非馬來西亞公民無論持有該不動產時間長短，稅率一概為30%。
馬來西亞報稅時間
個人所得稅報稅時間：每年的4月30日前
個體戶/合伙企業做賬報稅時間：每年6月30日之前
有限公司做賬報稅時間：新注冊的馬來新亞公司報稅時間是在18個月內要完成做賬、審計和報稅；如果是成立第二年或以上的公司要根據公司所制定的會計年度的6個月內要完成做賬、審計和報稅。
馬來西亞公司逾期報稅的后果
