潔凈廠房的建筑圍護結構和室內裝修，應選用氣密性良好，且在溫度和濕度變化時變形小、污染物濃度符合現行國家有關標準規定限值的材料。潔凈室裝飾材料及密封材料不得采用釋放對室內各種產品品質有影響物質的材料。潔凈室內墻壁和頂棚的裝修應符合下列規定：潔凈室內墻壁和頂棚的表面應平整、光滑、不起塵、避免眩光，便于除塵，并應減少凹凸面，踢腳不應突出墻面。潔凈室不宜采用砌筑墻抹灰墻面，當必須采用時宜采用干燥作業，抹灰應采用符合現行國家標準《建筑裝飾裝修工程質量驗收規范》中gaoji抹灰的要求。墻面抹灰后應刷涂料面層，并應選用難燃、不開裂、耐腐蝕、耐清洗、表面光滑、不易吸水變質發霉的涂料。
潔凈廠房地面應符合生產工藝要求；潔凈廠房地面應平整，耐磨、易清洗、不開裂，且不易積聚靜電；地面墊層宜配筋，潮濕地區墊層應有防潮措施。潔凈廠房技術夾層的墻壁和頂棚表面宜平整、光滑，位于地下的技術夾層應采取防水或防潮、防霉措施。潔凈區和人員凈化用室設置外窗時，應采用雙層玻璃固定窗，并應有良好的氣密性。潔凈室內的密閉門應朝空氣潔凈度較高的房間開啟，并應加設閉門器，無窗潔凈室的密閉門上宜設觀察窗。潔凈廠房門窗、墻壁、頂棚等的設計應符合下列規定：潔凈廠房門窗、墻壁、頂棚、地（樓）面及施工縫隙均應采取可靠的密閉措施；當采用輕質構造頂棚做技術夾層時，夾層內宜設檢修通道；潔凈廠房窗宜與內墻面齊平，不宜設窗臺。潔凈室內的色彩宜淡雅柔和。室內頂棚和墻面表面材料的光反射系數宜為0.6～0.8，地面表面材料的光反射系數宜為0.15～0.35。潔凈度等級嚴于8級的潔凈室的墻板和頂棚宜采用輕質壁板。室內裝修材料的燃燒性能必須符合現行國家標準《建筑內部裝修設計防火規范》的有關規定。裝修材料的煙密度等級不應大于50，材料的煙密度等級試驗應符合現行國家標準《建筑材料燃燒或分解的煙密度試驗方法》的有關規定。